Наподобява знамето на Кения, като в лявата му част са добавени син триъгълник и златна звезда. Черното символизира южните суданци, бялото – мира, а кръвта, пролята във войните, е представена с червения цвят. Зеленото е символ на земята, синьото – на водите на река Нил, а златната звезда въплъщава единството на южносуданските провинции.[2]